MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 90597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009633	AAC	2	6	207687	207692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388029
3502	NC_009633	TGA	2	6	207738	207743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388029
3503	NC_009633	CAA	2	6	207789	207794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388029
3504	NC_009633	ACCT	2	8	207902	207909	25 %	25 %	0 %	50 %	150388029
3505	NC_009633	GAA	2	6	207941	207946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388029
3506	NC_009633	GA	3	6	208014	208019	50 %	0 %	50 %	0 %	150388029
3507	NC_009633	TAC	2	6	208052	208057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388029
3508	NC_009633	GAG	2	6	208121	208126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388029
3509	NC_009633	ACA	2	6	208310	208315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388029
3510	NC_009633	AGC	2	6	208350	208355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388029
3511	NC_009633	CAG	2	6	208402	208407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388029
3512	NC_009633	GAT	2	6	208426	208431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388029
3513	NC_009633	AG	3	6	208474	208479	50 %	0 %	50 %	0 %	150388029
3514	NC_009633	TAGT	2	8	208487	208494	25 %	50 %	25 %	0 %	150388029
3515	NC_009633	TAC	2	6	208510	208515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388029
3516	NC_009633	ACA	2	6	208523	208528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388029
3517	NC_009633	CTAC	2	8	208575	208582	25 %	25 %	0 %	50 %	150388029
3518	NC_009633	ATT	2	6	208622	208627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388029
3519	NC_009633	CAA	2	6	208907	208912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388030
3520	NC_009633	TCC	2	6	208942	208947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150388030
3521	NC_009633	GCG	2	6	208966	208971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150388030
3522	NC_009633	TTA	2	6	208984	208989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388030
3523	NC_009633	CGA	2	6	209091	209096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388030
3524	NC_009633	CAG	2	6	209163	209168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388030
3525	NC_009633	G	6	6	209230	209235	0 %	0 %	100 %	0 %	150388030
3526	NC_009633	AAG	2	6	209297	209302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388030
3527	NC_009633	ATG	2	6	209393	209398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388030
3528	NC_009633	GGGC	2	8	209449	209456	0 %	0 %	75 %	25 %	150388030
3529	NC_009633	GTG	3	9	209527	209535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388030
3530	NC_009633	AATGA	2	10	209560	209569	60 %	20 %	20 %	0 %	150388030
3531	NC_009633	GTTT	2	8	209582	209589	0 %	75 %	25 %	0 %	150388030
3532	NC_009633	CTA	2	6	209653	209658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388030
3533	NC_009633	AGA	2	6	209664	209669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388030
3534	NC_009633	TAG	2	6	209789	209794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388030
3535	NC_009633	GA	3	6	209811	209816	50 %	0 %	50 %	0 %	150388030
3536	NC_009633	CCTA	2	8	209819	209826	25 %	25 %	0 %	50 %	150388030
3537	NC_009633	AGG	2	6	209961	209966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388030
3538	NC_009633	CAAAGG	2	12	210236	210247	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150388030
3539	NC_009633	CATCGT	2	12	210280	210291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150388030
3540	NC_009633	ATA	2	6	210299	210304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388030
3541	NC_009633	TCA	2	6	210341	210346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388030
3542	NC_009633	ATC	2	6	210395	210400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388030
3543	NC_009633	CAA	2	6	210446	210451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388030
3544	NC_009633	AAG	2	6	210499	210504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388030
3545	NC_009633	TAG	2	6	210505	210510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388030
3546	NC_009633	TAA	2	6	211315	211320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388031
3547	NC_009633	A	6	6	211348	211353	100 %	0 %	0 %	0 %	150388031
3548	NC_009633	AGG	2	6	211368	211373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388031
3549	NC_009633	TAT	2	6	211402	211407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388031
3550	NC_009633	TGC	2	6	211451	211456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388031
3551	NC_009633	ATT	2	6	211476	211481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388031
3552	NC_009633	GAT	2	6	211506	211511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3553	NC_009633	AGA	2	6	211527	211532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388031
3554	NC_009633	ATT	2	6	211576	211581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388031
3555	NC_009633	CAA	2	6	211591	211596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388031
3556	NC_009633	TGC	2	6	211637	211642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388031
3557	NC_009633	GT	3	6	211660	211665	0 %	50 %	50 %	0 %	150388031
3558	NC_009633	ATG	2	6	211678	211683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3559	NC_009633	TAG	2	6	211700	211705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3560	NC_009633	CTG	2	6	211867	211872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388031
3561	NC_009633	ACA	2	6	211887	211892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388031
3562	NC_009633	GAT	2	6	211896	211901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3563	NC_009633	GAA	2	6	211947	211952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388031
3564	NC_009633	ATG	2	6	212092	212097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3565	NC_009633	TGC	2	6	212192	212197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388031
3566	NC_009633	TGG	2	6	212228	212233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388031
3567	NC_009633	TAG	2	6	212257	212262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3568	NC_009633	TGA	3	9	212345	212353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3569	NC_009633	GAA	3	9	212382	212390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388031
3570	NC_009633	AGA	2	6	212415	212420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388031
3571	NC_009633	GTAGAT	2	12	212460	212471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3572	NC_009633	TA	3	6	212554	212559	50 %	50 %	0 %	0 %	150388031
3573	NC_009633	GAA	3	9	212565	212573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388031
3574	NC_009633	TGA	2	6	212621	212626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3575	NC_009633	GTG	2	6	212707	212712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388031
3576	NC_009633	AGT	2	6	212723	212728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3577	NC_009633	AGT	2	6	212762	212767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3578	NC_009633	TGATA	2	10	212816	212825	40 %	40 %	20 %	0 %	150388031
3579	NC_009633	AGA	2	6	212843	212848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388031
3580	NC_009633	AATT	2	8	212863	212870	50 %	50 %	0 %	0 %	150388031
3581	NC_009633	TGA	2	6	212939	212944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
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3583	NC_009633	CTG	2	6	213055	213060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388031
3584	NC_009633	TGA	2	6	213131	213136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388031
3585	NC_009633	GGA	2	6	213192	213197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388031
3586	NC_009633	TTC	2	6	213242	213247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388031
3587	NC_009633	GCT	2	6	213285	213290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388031
3588	NC_009633	GAA	2	6	213340	213345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388031
3589	NC_009633	TAT	2	6	213415	213420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388031
3590	NC_009633	CAA	2	6	213562	213567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388031
3591	NC_009633	TTG	2	6	213763	213768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388032
3592	NC_009633	TGG	2	6	213782	213787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388032
3593	NC_009633	ATTTGA	2	12	213863	213874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150388032
3594	NC_009633	TAC	2	6	213905	213910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388032
3595	NC_009633	GAAG	2	8	213921	213928	50 %	0 %	50 %	0 %	150388032
3596	NC_009633	GTA	2	6	213975	213980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388032
3597	NC_009633	ATT	3	9	214002	214010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388032
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3600	NC_009633	GAA	2	6	214086	214091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388032
3601	NC_009633	GAA	2	6	214101	214106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388032
3602	NC_009633	AAG	2	6	214111	214116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388032
3603	NC_009633	GAA	2	6	214125	214130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388032
3604	NC_009633	AAT	2	6	214139	214144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388032
3605	NC_009633	ACG	2	6	214147	214152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388032
3606	NC_009633	TAT	2	6	214167	214172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388032
3607	NC_009633	GAT	3	9	214212	214220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388032
3608	NC_009633	TCT	2	6	214241	214246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388032
3609	NC_009633	GAT	2	6	214380	214385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388032
3610	NC_009633	GGA	2	6	214421	214426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388032
3611	NC_009633	GA	3	6	214457	214462	50 %	0 %	50 %	0 %	150388032
3612	NC_009633	GTT	2	6	214494	214499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388032
3613	NC_009633	GTAAA	2	10	214514	214523	60 %	20 %	20 %	0 %	150388032
3614	NC_009633	ACA	2	6	215028	215033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388033
3615	NC_009633	GAA	2	6	215074	215079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388033
3616	NC_009633	GAA	2	6	215098	215103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388033
3617	NC_009633	AGC	2	6	215187	215192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388033
3618	NC_009633	A	6	6	215293	215298	100 %	0 %	0 %	0 %	150388033
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3989	NC_009633	AAAG	2	8	233626	233633	75 %	0 %	25 %	0 %	150388045
3990	NC_009633	AGCAAT	2	12	233634	233645	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150388045
3991	NC_009633	CTA	2	6	233712	233717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388045
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